오늘의 논읽남 : Transforming Fusions of FGFR and TACC Genes in Human Glioblastoma 외

Transforming Fusions of FGFR and TACC Genes in Human Glioblastoma, Science 2012

1. RNA-Seq 으로 Gene Fusion Event 를 뒤벼봄. TX-Fuse라고 명명한 새로운 파이프라인 (서플 메소드 참조) 으로 Fusion 이벤트 뒤벼본 결과 Fibroblast Growth Factor Receptor와 TACC 라는 유전자의 coiled-coil region 이 짬뽕된 것을 발견. 그닥 높은 빈도로 일어나는 것은 아니고 3/97 (흠 100개 정도는 샘플을 뒤벼봐야 이런데 명함을 내밀수 있다는게 요즘 현시세이군 ㅋ)

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이정도는 되어야 fusion의 evidence가 충분하다고 할 수 있습죠 ㅋ 

2. 그리고 해당 Fusion 유전자를 Lentiviral vector 에 넣어서 transduce 한 결과 Astrocyte 레벨, 혹은 동물레벨에서 레알 해당 퓨전유전자가 암유발 한다는 것을 보임. (Fig.2) 뭐 사실 이런 이야기 가지고 중추신경 가려면 당연히 이 데이터가 있어야겠져. 단순히 암조직에서 퓨전 유전자 뭐뭐 있슴다 가지고는 요즘은 무리 ㅋ 

3. 보통 Receptor Tryrosine Kinase는  리간드가 붙으면 Dimerization 되서 Kinase Activation하고 Signaling Cascade가 전달되므로 Coiled-Coil 이 짬뽕되었으니 그냥 내내 Turn on 되는거겠네..라고 생각했는데 그건 아니라고 함. 대신 엉뚱하게 Spindle Pole에 들러붙는다는 것을 확인. 왜 그 단백질이 거기가고, 가서 뭐하냐는 몰겠지만, 암튼 엉뚱한데 가서 카이네이션 하고 개판치나부지. 

4. FGFR Tyrosine Kinase 쳐보니 해당 Fusion에 의해서 유도된 tumor growth 를 저해함. 즉 Tyrosine Kinase 활성 때문에 이런 문제가 생기는 것은 맞음 (Fig.4)

뭐 여튼 극히 일부의 Giloblastoma 에서는 요런 메커니즘으로 Gene Fusion Event가 일어난다는 이야기. 물론 이거 말고도 대박 많겠지만…하나 제대로 건져서 과학 득템. ㅋ 뭐 시퀀싱은 거들뿐이져. 

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